根據2009年12月省政府批準的“三定”方案，江西省公路運輸管理局為江西省交通運輸廳管理的副廳級全額撥款事業(yè)單位，代表政府對全省道路運輸行使行業(yè)管理職能。現(xiàn)局機關內設黨委辦公室、辦公室、法規(guī)稽查處（運政執(zhí)法辦公室）、財務審計處、客貨運輸管理處、城市客運管理處（出租汽車行業(yè)指導辦公室）、計劃基建處、車輛技術管理處、安全監(jiān)督處、駕駛員培訓管理處（道路運輸從業(yè)人員資格管理辦公室）、科技信息處、組織人事處、離退休干部處、監(jiān)察室（與紀委合署辦公）等14個處室，下設局機關后勤服務中心。省公路運輸管理局機關全額撥款事業(yè)編制98名，后勤服務中心事業(yè)編制18名。其主要職責是：（一）貫徹執(zhí)行國家有關道路運輸、城市客運的法律法規(guī)和方針政策，擬訂有關政策、準入制度、技術規(guī)范、營運標準并監(jiān)督實施；（二）承擔全省道路旅客運輸、道路貨物運輸、站（場）、機動車維修、營運車輛綜合性能檢測、機動車駕駛員培訓管理的具體工作；（三）承擔指導全省城市公交、出租車、軌道交通管理的具體工作；（四）負責跨省（自治區(qū)、直轄市）、跨設區(qū)市道路旅客運輸許可和道路旅客運輸增加班線許可；（五）負責國際道路運輸許可；（六）組織實施道路運輸經理人和機動車駕駛培訓教練員從業(yè)資格考試；（七）依法實施道路運輸行政處罰，對道路運輸管理機構的執(zhí)法活動進行指導監(jiān)督；（八）承擔搶險、救災、戰(zhàn)略物資等緊急道路運輸任務和指令性計劃運輸的具體組織實施；（九）承擔省交通運輸廳交辦的其他事項。