昆明海關前身為蒙自關，于1889年8月開關，1942年蒙自、騰越兩關合并，始稱昆明關。1980年體制改革，昆明關更名為昆明海關，是首批批準升格的9個局級關之一。目前，昆明海關內(nèi)設機構21個（含緝私局），下設隸屬海關單位31個（含風險防控分局）、派駐紀檢組15個、19個事業(yè)單位和9個緝私分局，機構設置基本與云南對外開放格局相適應。關區(qū)現(xiàn)有干部職工2340余人（包括緝私警察330余人）。轄區(qū)共有口岸25個，海關特殊監(jiān)管區(qū)域2個，保稅監(jiān)管場所15個(2個保稅物流園區(qū)中心B型、3個出口監(jiān)管倉、10個保稅倉庫)。