根據(jù)《國務(wù)院關(guān)于地方改革完善食品藥品監(jiān)督管理體制的指導意見》（國發(fā)〔2013〕18號）和《重慶市人民政府關(guān)于改革完善食品藥品監(jiān)督管理體制的實施意見》（渝府發(fā)〔2013〕48號），設(shè)立重慶市食品藥品監(jiān)督管理局（正廳局級），掛重慶市食品安全委員會辦公室牌子，為重慶市人民政府直屬機構(gòu)。其主要職責：（一）負責貫徹實施食品（含食品添加劑、保健食品，下同）安全、藥品（含中藥、民族藥，下同）、醫(yī)療器械、化妝品監(jiān)督管理的法律、法規(guī)、規(guī)章和方針政策；負責起草地方性法規(guī)和規(guī)章，擬訂地方性政策、規(guī)劃并監(jiān)督實施。推動建立落實食品藥品安全企業(yè)主體責任、地方人民政府負總責的機制，建立食品藥品重大信息直報制度，并組織實施和監(jiān)督檢查，著力防范區(qū)域性、系統(tǒng)性食品藥品安全風險。（二）負責組織落實食品行政許可的實施辦法。建立食品安全隱患排查治理機制，制定全市食品安全檢查年度計劃、重大整頓治理方案并組織落實。負責建立食品安全信息統(tǒng)一公布制度，公布重大食品安全信息。參與制定食品安全風險監(jiān)測計劃實施方案、食品安全地方標準，根據(jù)食品安全風險監(jiān)測計劃實施方案開展食品安全風險監(jiān)測工作。（三）負責組織實施國家藥典等藥品和醫(yī)療器械標準、分類管理制度。負責組織實施藥品和醫(yī)療器械研制、生產(chǎn)、經(jīng)營、使用質(zhì)量管理規(guī)范。負責藥品和醫(yī)療器械的注冊、生產(chǎn)許可、經(jīng)營許可并監(jiān)督檢查。建立藥品、化妝品不良反應(yīng)和醫(yī)療器械不良事件監(jiān)測體系，并開展監(jiān)測和處置工作。組織實施執(zhí)業(yè)藥師資格準入制度，負責執(zhí)業(yè)藥師注冊登記。參與制定地方增補基本藥物目錄，配合實施基本藥物制度。組織實施化妝品監(jiān)督管理辦法。（四）負責制定食品、藥品、醫(yī)療器械、化妝品監(jiān)督管理的稽查制度并組織實施，組織查處重大違法行為。規(guī)范行政執(zhí)法行為，完善行政執(zhí)法與刑事司法銜接機制。建立問題產(chǎn)品召回和處置制度并監(jiān)督實施。（五）負責食品藥品安全事故應(yīng)急體系建設(shè)，組織和指導食品藥品安全事故應(yīng)急處置和調(diào)查處理工作，監(jiān)督事故查處落實情況。（六）負責制定食品藥品安全科技發(fā)展規(guī)劃并組織實施，推動食品藥品檢驗檢測體系、電子監(jiān)管追溯體系和信息化建設(shè)。（七）負責開展食品藥品安全宣傳、教育培訓、對外交流與合作。推進誠信體系建設(shè)。（八）承擔重慶市食品安全委員會日常工作。負責食品安全監(jiān)督管理綜合協(xié)調(diào)，推動健全協(xié)調(diào)聯(lián)動機制。督促檢查區(qū)縣（自治縣）人民政府履行食品藥品安全監(jiān)督管理職責并負責考核評價。（九）承辦重慶市人民政府以及重慶市食品安全委員會交辦的其他事項。