重慶市是交通運輸部在全國交通系統(tǒng)進行交通綜合行政執(zhí)法體制改革的兩個試點省市之一（另為廣東），自1994年4月啟動高速公路綜合執(zhí)法體制創(chuàng)新和探索，到2002年10月由國務(wù)院確定為綜合執(zhí)法試點地區(qū)，再到2005年6月重慶市交通行政執(zhí)法總隊成立，成為全國唯一一個集路政、運政、港航和高速公路交通安全管理等職能于一體的交通綜合執(zhí)法機構(gòu)?？傟牂C關(guān)內(nèi)設(shè)綜合處、政治處、法制處、科技信息處、勤務(wù)管理處、事故對策處、財務(wù)處、紀檢督察室和指揮中心，下設(shè)直屬支隊、高速公路五個支隊等6個正處級單位及46個正科級執(zhí)法大隊和1個投訴服務(wù)中心，實行“總隊—支隊—大隊”扁平化管理，對實行交通綜合執(zhí)法的11個遠郊區(qū)縣進行業(yè)務(wù)指導。直屬支隊負責主城區(qū)公路路政、公路運政、地方水域綜合執(zhí)法管理。高速公路五個支隊負責全市已通車3023公里高速公路交通安全、公路路政、公路運政綜合執(zhí)法工作。