浙江省舟山海洋生態(tài)環(huán)境監(jiān)測(cè)站是1987年由國家環(huán)保局和浙江省人民政府批準(zhǔn)在原舟山市環(huán)境監(jiān)測(cè)站的基礎(chǔ)上建立的，是全國環(huán)保系統(tǒng)目前唯一的專業(yè)海洋生態(tài)環(huán)境監(jiān)測(cè)一級(jí)站。本站具有獨(dú)立法人資格，行政上隸屬浙江省環(huán)保廳和舟山市人民政府的領(lǐng)導(dǎo)，業(yè)務(wù)上受中國環(huán)境監(jiān)測(cè)總站和浙江省環(huán)保廳指導(dǎo)，是具有技術(shù)監(jiān)督管理職能的社會(huì)公益性事業(yè)單位。1994年國家環(huán)保局組建近岸海域環(huán)境監(jiān)測(cè)網(wǎng)，我站任組長(zhǎng)單位。1997年6月國家環(huán)保總局在本站掛牌“國家環(huán)?？偩纸逗Ｓ颦h(huán)境監(jiān)測(cè)網(wǎng)中心站”，2002年6月調(diào)整為“中國環(huán)境監(jiān)測(cè)總站近岸海域環(huán)境監(jiān)測(cè)中心站”。是全國近岸海域環(huán)境監(jiān)測(cè)網(wǎng)絡(luò)的技術(shù)中心、信息中心和管理中心。2002年浙江省環(huán)保局批復(fù)設(shè)立浙江省海洋生態(tài)環(huán)境科學(xué)研究所。2013年6月1日，本站搬遷至位于舟山市新城體育路20號(hào)的新實(shí)驗(yàn)辦公大樓，大樓占地5720.5平方米、總建筑面積11937.8平方米。實(shí)驗(yàn)室配有271臺(tái)（套）各類采樣及分析設(shè)備，主要設(shè)備有：三重四級(jí)桿氣質(zhì)聯(lián)用儀、電感耦合等離子體質(zhì)譜儀、電感耦合等離子發(fā)射光譜儀、液質(zhì)聯(lián)用儀、氣相色譜儀、離子色譜儀、分子熒光光度計(jì)、流動(dòng)注射儀、原子吸收分光光度計(jì)、有機(jī)碳測(cè)定儀、粒度儀、熒光生物顯微鏡及圖像工作站、倒置生物顯微鏡等一系列先進(jìn)儀器，各類儀器設(shè)備的功能基本滿足各項(xiàng)實(shí)驗(yàn)分析的需要，另有站局域網(wǎng)和數(shù)據(jù)傳輸網(wǎng)絡(luò)設(shè)備各一套。擁有一艘498總噸的科學(xué)調(diào)查船，船上配有基本的通訊、導(dǎo)航設(shè)備和3個(gè)海洋環(huán)境調(diào)查監(jiān)測(cè)實(shí)驗(yàn)室。配備一輛環(huán)境應(yīng)急監(jiān)測(cè)車,車上配有大氣自動(dòng)監(jiān)測(cè)系統(tǒng)、氣象系統(tǒng)、便攜式氣相色譜儀、多參數(shù)水質(zhì)監(jiān)測(cè)儀、輻射監(jiān)測(cè)儀、應(yīng)急監(jiān)測(cè)箱及應(yīng)急數(shù)據(jù)傳輸系統(tǒng)。1996年首次通過國家級(jí)計(jì)量認(rèn)證，通過多年來的計(jì)量認(rèn)證復(fù)評(píng)審、擴(kuò)項(xiàng)評(píng)審及監(jiān)督評(píng)審，監(jiān)測(cè)工作質(zhì)量管理體系日臻完善。目前，有資質(zhì)開展的監(jiān)測(cè)項(xiàng)目包括水（含大氣降水）和廢水、環(huán)境空氣和廢氣、土壤/底質(zhì)/固體廢棄物、噪聲、海水水質(zhì)、海洋沉積物/生物體、海洋生物、室內(nèi)空氣、電磁輻射、電離輻射等共十四大類339項(xiàng)523個(gè)參數(shù)。從事海洋環(huán)境監(jiān)測(cè)工作三十多年來，經(jīng)歷了由小到大、由弱到強(qiáng)的發(fā)展過程，海洋生態(tài)環(huán)境監(jiān)測(cè)技術(shù)手段和技術(shù)力量逐步得到加強(qiáng)，具備飲用水109項(xiàng)全項(xiàng)目監(jiān)測(cè)分析能力及全面開展海洋生態(tài)環(huán)境調(diào)查監(jiān)測(cè)、進(jìn)行海洋生態(tài)環(huán)境監(jiān)測(cè)研究和參與國際合作項(xiàng)目的條件和能力，以適應(yīng)和滿足海洋環(huán)境管理工作的需要。