根據(jù)《中共惠州市委、惠州市人民政府關(guān)于印發(fā)<惠州市人民政府機(jī)構(gòu)改革方案>的通知》（惠市委發(fā)〔2009〕25號），設(shè)立惠州市海洋與漁業(yè)局，為市人民政府工作部門。其主要職責(zé)是：一、貫徹執(zhí)行國家、省和市有關(guān)海洋與漁業(yè)工作的方針政策和法律法規(guī)，組織海洋戰(zhàn)略研究，擬訂并監(jiān)督實(shí)施海洋事業(yè)、漁業(yè)的發(fā)展戰(zhàn)略、政策和管理制度。二、綜合管理、協(xié)調(diào)和指導(dǎo)海洋開發(fā)利用和保護(hù)，負(fù)責(zé)海岸帶開發(fā)利用和保護(hù)的有關(guān)工作。三、承擔(dān)海洋經(jīng)濟(jì)運(yùn)行監(jiān)測、評價(jià)及信息發(fā)布的責(zé)任，組織實(shí)施海洋與漁業(yè)經(jīng)濟(jì)和社會(huì)發(fā)展的統(tǒng)計(jì)、核算，提出優(yōu)化海洋經(jīng)濟(jì)結(jié)構(gòu)、調(diào)整產(chǎn)業(yè)布局的建議，組織開展海洋與漁業(yè)領(lǐng)域節(jié)能減排和應(yīng)對氣候變化的工作。四、承擔(dān)規(guī)范管轄海域使用秩序的責(zé)任。監(jiān)督管理國家、省授權(quán)的海域使用，承擔(dān)海域使用項(xiàng)目審核和海域使用權(quán)屬管理及海上人工構(gòu)筑特管理，組織海域界線、海岸線勘定和管理，監(jiān)督管理海底電纜管道鋪設(shè)、海上人工構(gòu)筑物設(shè)置，負(fù)責(zé)涉海工程項(xiàng)目的有關(guān)工作。五、承擔(dān)海島生態(tài)保護(hù)和無居民海島合法使用管理的責(zé)任。擬訂海島保護(hù)與開發(fā)規(guī)劃、政策并監(jiān)督實(shí)施，組織實(shí)施無居民海島的使用管理。六、承擔(dān)海洋環(huán)境保護(hù)和修復(fù)的責(zé)任。組織海洋資源環(huán)境調(diào)查、監(jiān)測、監(jiān)視、評價(jià)和信息發(fā)布，組織實(shí)施重點(diǎn)海域排污總量控制制度，監(jiān)督海洋傾廢、陸源污染物排海，負(fù)責(zé)海洋與漁業(yè)水域生態(tài)環(huán)境保護(hù)、水生生物資源保護(hù)，監(jiān)督管理海洋、漁業(yè)自然保護(hù)區(qū)和特別保護(hù)區(qū)，負(fù)責(zé)保護(hù)修復(fù)典型性、代表性海洋生態(tài)系統(tǒng)，管理國家、省分工的海洋自然資源。七、承擔(dān)海洋環(huán)境觀測預(yù)報(bào)、海洋災(zāi)害預(yù)警預(yù)報(bào)和漁業(yè)防災(zāi)減災(zāi)的責(zé)任，負(fù)責(zé)海洋與漁業(yè)突發(fā)公共事件應(yīng)急工作。八、組織落實(shí)漁業(yè)和漁區(qū)發(fā)展政策措施，指導(dǎo)漁業(yè)產(chǎn)業(yè)結(jié)構(gòu)調(diào)整、產(chǎn)品品質(zhì)改善、漁業(yè)產(chǎn)業(yè)化和可持續(xù)發(fā)展，組織開展水生生物疫病防控工作，實(shí)施符合安全標(biāo)準(zhǔn)的水產(chǎn)品認(rèn)證，負(fù)責(zé)初級水產(chǎn)品生產(chǎn)環(huán)節(jié)質(zhì)量安全監(jiān)管，發(fā)布水產(chǎn)品質(zhì)量安全信息，組織指導(dǎo)漁業(yè)基礎(chǔ)設(shè)施建設(shè)。九、負(fù)責(zé)漁業(yè)許可和漁港、漁船、漁具漁法和漁業(yè)電信的監(jiān)督管理，組織實(shí)施伏季休漁制度。十、組織實(shí)施“科技興?！?、“科技興漁”戰(zhàn)略，組織海洋與漁業(yè)科學(xué)技術(shù)研究和應(yīng)用推廣，組織實(shí)施海水利用和海洋可再生能源研發(fā)應(yīng)用，承擔(dān)海洋與漁業(yè)科技創(chuàng)新體系和數(shù)字海洋建設(shè)。十一、組織開展海洋與漁業(yè)方面的對外交流與合作。十二、承擔(dān)海洋監(jiān)察、漁政管理、漁港監(jiān)督和漁業(yè)船舶監(jiān)督、檢驗(yàn)的責(zé)任。負(fù)責(zé)轄區(qū)內(nèi)的巡航監(jiān)視、監(jiān)督管理，查處違法活動(dòng)，維護(hù)國家海洋與漁業(yè)權(quán)益，管理市海洋與漁業(yè)執(zhí)法隊(duì)伍。十三、承辦市人民政府和省海洋與漁業(yè)局交辦的其他事項(xiàng)。