南平市地方海事局、南平市水路運(yùn)輸管理處成立于2003年6月，2004年6月原省航道局南平辦事處并入市水路運(yùn)輸管理處（原省航道局設(shè)在武夷山的航道管理站同時(shí)更名為南平市港航管理處武夷山港航管理所），實(shí)行四塊牌子一套人馬，統(tǒng)一管理、統(tǒng)一執(zhí)法，為副處級(jí)行政類事業(yè)單位。設(shè)有九個(gè)職能科（室）所，即辦公室、運(yùn)輸管理科、安全監(jiān)督科、航務(wù)科、船舶檢驗(yàn)科、港務(wù)管理科、航道管理科、沙溪口水路運(yùn)輸安全管理所和南平市港航管理處武夷山港航管理所，均為副科級(jí)。局（處）機(jī)關(guān)設(shè)有南平市地方海事局黨支部、南平市水路運(yùn)輸管理處黨支部，書記由局長兼任。為第九屆、第十屆、第十一屆省級(jí)文明單位，第十二屆市級(jí)文明單位；連續(xù)兩屆獲得“全國海事系統(tǒng)文明執(zhí)法示范窗口標(biāo)兵”單位。其主要職能：貫徹執(zhí)行國家有關(guān)水路運(yùn)輸行業(yè)發(fā)展戰(zhàn)略、方針、政策和法規(guī)；擬訂全市水路運(yùn)輸行業(yè)規(guī)章制度，經(jīng)批準(zhǔn)后負(fù)責(zé)實(shí)施、協(xié)調(diào)和監(jiān)督；編制全市水路運(yùn)輸行業(yè)的發(fā)展規(guī)劃，中長期和年度計(jì)劃并負(fù)責(zé)監(jiān)督實(shí)施；負(fù)責(zé)全市水路運(yùn)輸市場管理，維護(hù)水路運(yùn)輸行業(yè)的平等競爭，負(fù)責(zé)水路交通運(yùn)輸?shù)慕M織管理；負(fù)責(zé)轄區(qū)水上交通安全監(jiān)督、管理；負(fù)責(zé)實(shí)施轄內(nèi)水上交通管制；負(fù)責(zé)轄內(nèi)船舶和船員管理；負(fù)責(zé)轄內(nèi)船舶、水上設(shè)施法定檢驗(yàn)；負(fù)責(zé)轄區(qū)港口航道行政管理、維護(hù)、建設(shè)、規(guī)費(fèi)征收等職能。