濟寧市港航局是主管全市港航工作的行政機關，主要職責是：制定全市港航事業(yè)發(fā)展戰(zhàn)略，編制全市水路運輸發(fā)展規(guī)劃，監(jiān)督管理全市水路運輸市場和基礎設施建設市場，規(guī)范市場行為，負責全市水路運輸?shù)拇皺z驗、船員培訓及全市港口、航道布局規(guī)劃，組織港航基礎設施的建設、養(yǎng)護和管理，負責全市水上交通安全的監(jiān)督管理和全市航運規(guī)費的征收、管理。目前，市港航局機關內設辦公室、人事科、計財科、水運安全科、航政法規(guī)科、監(jiān)察室、六個科室，下轄21個事業(yè)單位，其中: 市地方海事局為正處級事業(yè)單位, 市航道管理處、市水路交通稽查支隊為副處級事業(yè)單位。